财付通违规被整改，原因是有网友举报财付通为涉嫌“二次清算”的京东商城关联公司提供支付服务，根据此网友提供的信息来看，央行营管部已经要求京东商城和财付通进行整改工作，目前国家对二次清算的整顿比较严，且在6月底需要完成处罚与总结工作。